Protein–RNA interactions for Protein: P04184

Tk1, Thymidine kinase, cytosolic, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk1P04184 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tk1P04184 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tk1P04184 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tk1P04184 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms