Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

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Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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H2-Ab1P01921 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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H2-Ab1P01921 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H2-Ab1P01921 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
H2-Ab1P01921 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H2-Ab1P01921 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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H2-Ab1P01921 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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H2-Ab1P01921 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Ab1P01921 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Ab1P01921 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Ab1P01921 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Ab1P01921 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Ab1P01921 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Ab1P01921 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Ab1P01921 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Ab1P01921 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
H2-Ab1P01921 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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H2-Ab1P01921 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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H2-Ab1P01921 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
H2-Ab1P01921 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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H2-Ab1P01921 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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