Protein–RNA interactions for Protein: P01821

Ig heavy chain V region MC101, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01821 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P01821 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01821 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01821 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01821 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P01821 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01821 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01821 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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