Protein–RNA interactions for Protein: P01729

Ig lambda-2 chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01729 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01729 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
P01729 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01729 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01729 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01729 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
P01729 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
P01729 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
P01729 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
P01729 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
P01729 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms