Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01678 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01678 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01678 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01678 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01678 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01678 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01678 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01678 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01678 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01678 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01678 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01678 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01678 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01678 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01678 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01678 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01678 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01678 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01678 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01678 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01678 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01678 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01678 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01678 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01678 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01678 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01678 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01678 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01678 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01678 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01678 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01678 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01678 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01678 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01678 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01678 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01678 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01678 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01678 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01678 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms