Protein–RNA interactions for Protein: P01675

Ig kappa chain V-VI region XRPC 44, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01675 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01675 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01675 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01675 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01675 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01675 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01675 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01675 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01675 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01675 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01675 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01675 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01675 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01675 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01675 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01675 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01675 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01675 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01675 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01675 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01675 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01675 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01675 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01675 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01675 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01675 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01675 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01675 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01675 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01675 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01675 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01675 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01675 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01675 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01675 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01675 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01675 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01675 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01675 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01675 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01675 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01675 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01675 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01675 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01675 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01675 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01675 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01675 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01675 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01675 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01675 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01675 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01675 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01675 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01675 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01675 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms