Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
P01672 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
P01672 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
P01672 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
P01672 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01672 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01672 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
P01672 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms