Protein–RNA interactions for Protein: P01669

Ig kappa chain V-III region PC 7769, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01669 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01669 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01669 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01669 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01669 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01669 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01669 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01669 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01669 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01669 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01669 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms