Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P01649 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P01649 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P01649 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P01649 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P01649 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P01649 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P01649 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P01649 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P01649 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P01649 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
P01649 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
P01649 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
P01649 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
P01649 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
P01649 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms