Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01641 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01641 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01641 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01641 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01641 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01641 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01641 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01641 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01641 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01641 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01641 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01641 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01641 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01641 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01641 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01641 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01641 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01641 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01641 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01641 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01641 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01641 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01641 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01641 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01641 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms