Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Igk-V19-17P01633 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Igk-V19-17P01633 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms