Protein–RNA interactions for Protein: O89112

Lancl1, LanC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl1O89112 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lancl1O89112 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms