Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tcn2O88968 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tcn2O88968 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms