Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Apaf1O88879 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Apaf1O88879 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms