Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tom1O88746 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tom1O88746 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tom1O88746 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tom1O88746 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tom1O88746 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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