Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Hcn2O88703 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hcn2O88703 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms