Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BlmO88700 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BlmO88700 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BlmO88700 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BlmO88700 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BlmO88700 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BlmO88700 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BlmO88700 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BlmO88700 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BlmO88700 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BlmO88700 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BlmO88700 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BlmO88700 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BlmO88700 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BlmO88700 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BlmO88700 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BlmO88700 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BlmO88700 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BlmO88700 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BlmO88700 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BlmO88700 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BlmO88700 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BlmO88700 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BlmO88700 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BlmO88700 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BlmO88700 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BlmO88700 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BlmO88700 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BlmO88700 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BlmO88700 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BlmO88700 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BlmO88700 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BlmO88700 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BlmO88700 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BlmO88700 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BlmO88700 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BlmO88700 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BlmO88700 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BlmO88700 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BlmO88700 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BlmO88700 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BlmO88700 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BlmO88700 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BlmO88700 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BlmO88700 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BlmO88700 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BlmO88700 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BlmO88700 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BlmO88700 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BlmO88700 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BlmO88700 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BlmO88700 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BlmO88700 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BlmO88700 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BlmO88700 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BlmO88700 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BlmO88700 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BlmO88700 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BlmO88700 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BlmO88700 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BlmO88700 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BlmO88700 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BlmO88700 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BlmO88700 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BlmO88700 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BlmO88700 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BlmO88700 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BlmO88700 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BlmO88700 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BlmO88700 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BlmO88700 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BlmO88700 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BlmO88700 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BlmO88700 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BlmO88700 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BlmO88700 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BlmO88700 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BlmO88700 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BlmO88700 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BlmO88700 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BlmO88700 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BlmO88700 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BlmO88700 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BlmO88700 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BlmO88700 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BlmO88700 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BlmO88700 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BlmO88700 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BlmO88700 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms