Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cops6O88545 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops6O88545 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops6O88545 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops6O88545 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops6O88545 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cops6O88545 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cops6O88545 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cops6O88545 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops6O88545 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cops6O88545 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cops6O88545 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms