Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AurkcO88445 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
AurkcO88445 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
AurkcO88445 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AurkcO88445 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AurkcO88445 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms