Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nid2O88322 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nid2O88322 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nid2O88322 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nid2O88322 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nid2O88322 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid2O88322 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid2O88322 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid2O88322 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nid2O88322 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nid2O88322 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms