Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cd46O88174 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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