Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SfnO70456 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SfnO70456 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SfnO70456 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SfnO70456 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SfnO70456 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SfnO70456 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SfnO70456 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SfnO70456 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SfnO70456 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SfnO70456 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SfnO70456 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SfnO70456 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SfnO70456 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SfnO70456 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SfnO70456 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SfnO70456 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SfnO70456 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SfnO70456 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SfnO70456 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SfnO70456 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SfnO70456 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SfnO70456 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SfnO70456 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SfnO70456 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SfnO70456 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SfnO70456 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SfnO70456 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SfnO70456 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SfnO70456 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SfnO70456 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SfnO70456 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SfnO70456 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SfnO70456 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SfnO70456 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SfnO70456 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SfnO70456 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SfnO70456 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SfnO70456 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SfnO70456 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SfnO70456 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SfnO70456 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SfnO70456 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SfnO70456 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SfnO70456 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SfnO70456 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SfnO70456 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SfnO70456 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SfnO70456 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SfnO70456 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SfnO70456 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SfnO70456 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SfnO70456 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SfnO70456 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SfnO70456 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms