Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkbO70126 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkbO70126 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkbO70126 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AurkbO70126 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms