Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cyp26a1O55127 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp26a1O55127 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms