Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrxO55103 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrxO55103 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrxO55103 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrxO55103 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrxO55103 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PrxO55103 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrxO55103 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrxO55103 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrxO55103 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrxO55103 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrxO55103 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrxO55103 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PrxO55103 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrxO55103 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrxO55103 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrxO55103 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrxO55103 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrxO55103 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrxO55103 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrxO55103 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrxO55103 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrxO55103 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrxO55103 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrxO55103 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrxO55103 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrxO55103 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrxO55103 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PrxO55103 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PrxO55103 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PrxO55103 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrxO55103 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrxO55103 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrxO55103 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrxO55103 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrxO55103 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrxO55103 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrxO55103 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrxO55103 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrxO55103 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrxO55103 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrxO55103 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrxO55103 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PrxO55103 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PrxO55103 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrxO55103 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrxO55103 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrxO55103 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrxO55103 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrxO55103 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrxO55103 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrxO55103 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PrxO55103 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrxO55103 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrxO55103 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrxO55103 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrxO55103 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrxO55103 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrxO55103 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrxO55103 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrxO55103 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PrxO55103 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms