Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Syngr1O55100 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syngr1O55100 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms