Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sema6bO54951 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sema6bO54951 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sema6bO54951 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6bO54951 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6bO54951 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6bO54951 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6bO54951 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6bO54951 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6bO54951 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sema6bO54951 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sema6bO54951 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6bO54951 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6bO54951 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6bO54951 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6bO54951 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6bO54951 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sema6bO54951 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6bO54951 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6bO54951 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6bO54951 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6bO54951 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6bO54951 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6bO54951 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6bO54951 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6bO54951 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6bO54951 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6bO54951 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sema6bO54951 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6bO54951 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sema6bO54951 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6bO54951 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6bO54951 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6bO54951 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6bO54951 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6bO54951 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6bO54951 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6bO54951 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6bO54951 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6bO54951 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6bO54951 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6bO54951 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6bO54951 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6bO54951 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6bO54951 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sema6bO54951 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6bO54951 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6bO54951 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sema6bO54951 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6bO54951 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6bO54951 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6bO54951 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6bO54951 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6bO54951 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sema6bO54951 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6bO54951 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sema6bO54951 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6bO54951 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sema6bO54951 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6bO54951 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6bO54951 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6bO54951 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6bO54951 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sema6bO54951 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms