Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Itgb3O54890 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Itgb3O54890 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms