Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbrO54799 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbrO54799 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbrO54799 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
NmbrO54799 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms