Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Limk2O54785 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Limk2O54785 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms