Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc1a6O35544 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc1a6O35544 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms