Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clk4O35493 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk4O35493 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Clk4O35493 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Clk4O35493 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk4O35493 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Clk4O35493 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clk4O35493 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk4O35493 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Clk4O35493 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Clk4O35493 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Clk4O35493 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Clk4O35493 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clk4O35493 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Clk4O35493 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms