Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sema6aO35464 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms