Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
TnxbO35452 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
TnxbO35452 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TnxbO35452 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TnxbO35452 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TnxbO35452 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TnxbO35452 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TnxbO35452 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TnxbO35452 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TnxbO35452 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TnxbO35452 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TnxbO35452 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TnxbO35452 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TnxbO35452 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TnxbO35452 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TnxbO35452 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
TnxbO35452 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TnxbO35452 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
TnxbO35452 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TnxbO35452 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
TnxbO35452 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms