Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Foxd2O35392 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Foxd2O35392 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms