Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf5O35326 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf5O35326 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms