Protein–RNA interactions for Protein: O35188

Cx3cl1, Fractalkine, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cx3cl1O35188 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cx3cl1O35188 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms