Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad6O35182 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad6O35182 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad6O35182 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad6O35182 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Smad6O35182 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms