Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ArxO35085 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ArxO35085 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ArxO35085 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ArxO35085 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ArxO35085 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ArxO35085 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ArxO35085 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ArxO35085 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ArxO35085 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ArxO35085 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ArxO35085 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ArxO35085 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ArxO35085 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ArxO35085 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ArxO35085 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ArxO35085 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ArxO35085 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ArxO35085 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ArxO35085 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ArxO35085 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ArxO35085 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ArxO35085 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ArxO35085 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ArxO35085 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ArxO35085 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ArxO35085 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ArxO35085 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ArxO35085 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ArxO35085 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ArxO35085 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ArxO35085 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms