Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cldn4O35054 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn4O35054 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms