Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sypl1O09117 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sypl1O09117 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms