Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sec22bO08547 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sec22bO08547 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms