Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Vmn2r88L7N1W8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Vmn2r88L7N1W8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Vmn2r88L7N1W8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Vmn2r88L7N1W8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Vmn2r88L7N1W8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Vmn2r88L7N1W8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Vmn2r88L7N1W8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn2r88L7N1W8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn2r88L7N1W8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Vmn2r88L7N1W8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Vmn2r88L7N1W8 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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