Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Gm3542K7N6U2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm3542K7N6U2 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms