Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm2056J3QQ02 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm2056J3QQ02 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms