Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Gm8356J3QPD3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm8356J3QPD3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms