Protein–RNA interactions for Protein: J3QP37

Smim22, MCG1038270, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim22J3QP37 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Smim22J3QP37 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Smim22J3QP37 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms