Protein–RNA interactions for Protein: J3QM43

Gm6594, Predicted pseudogene 6594, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6594J3QM43 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm6594J3QM43 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms