Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Gm21060J3KMU4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Gm21060J3KMU4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms