Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm21411J3KMS0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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